ImageJ的功能很多（这是为什么我们一直在做ImageJ教程的一个原因），而且基本都是自动操作 。今天我们就来看看ImageJ是如何来计算实验照片中颗粒的粒径，尤其是圆形纳米颗粒的 。
如何分析细胞粒径？
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1.File ->Open ， 打开待分析示例图片（DAPI染核）：
2.设置标尺 ， 可得到实际粒径而不是像素 。
校正标尺：点击Straight工具
、按住Shift在标尺上画直线
Analyze ->Set Scale ， 在已知距离中填入10 μm，选择Global则校正标尺对本次打开所有图片均有效 。
3.转化为8-bit灰度图片：Image ->Type ->8-bit 。
选中待分析粒子：
Image -> Adjust -> Threshold 调节阈值 ， 选择所有阳性信号（红色代表选中，背景为黑色勾选Dark background）：
在ImageJ软件Analyze下选择Set Measurements设置测量参数，
选择Feret’s diameter与Limit to threshold只计算红色选择的面积） ， 点击OK 。
Feret’s diameter直径为某一形状边界任意两点之间的的最长距离，也称为最大距离 。
4. 在ImageJ软件Analyze下选择Analyze Particles ， 选择Display results和Add to Manager：
点击OK，得到结果：
5.
https://github.com/tferr/Scripts/blob/master/BAR/src/main/resources/scripts/BAR/Annotation/README.md#roi-color-coder
【想快速知道细胞的粒径？就用它吧】ROI Color Coder插件通过将测量值与查找LUT匹配来生成粒度大小的热图，从而对ROI Manager选择进行着色：
官网ROI Color Coder插件界面如下：
对于本粒子 ， 点击Plugins，选择ROI Color Coder：
Measurement选择Feret ， 点击OK，其他设置可见上图详细说明 。可得到根据粒径大小生成的热图，即不同粒径对应不同颜色：
如何得到粒径分布图？